在服务器端提供指纹比较的最佳方式

我将通过WebAPI从服务器端提供指纹身份验证。下面的代码是指纹比对部分。

var allFingerprints = container.Fingerprints.OrderByDescending(p=>p.FingerprintID);
List<Fmd> fmdList = new List<Fmd>();
foreach (var fp in allFingerprints)
{
    fmdList.Add(Fmd.DeserializeXml(fp.FMD));
}
IdentifyResult identifyResult = Comparison.Identify(customerFmd, 0, fmdList, thresholdScore, 2);

如果DB中有少量(<3000)指纹，我认为从DB中读取指纹并进行比较是可以的。但是，如果指纹的数量越来越大，服务器从客户端获得大量的API调用，从数据库读取指纹并进行比较的最佳方法是什么?我必须把指纹表保存在内存中并进行比较吗?感谢您的宝贵意见。