MySqlDataAdapter.Fill()缓慢/失败

我目前使用MySQL.Data扩展，以便将MySQL数据库信息加载到我的c#应用程序中。我使用MySqlDataAdapter.Fill()命令将数据加载到DataTable中。
这个解决方案适用于我的大多数表，除了较大的表。例如，我有一个大约1,310,634行的表。当我尝试用该数据填充DataTable时，应用程序将挂起并最终失败，并出现异常:

异常无法从传输连接中读取数据:连接尝试失败，因为被连接方在一段时间后没有正确响应，或已建立的连接失败，因为连接的主机未能响应。

我已经尝试了解决方案，我增加MySQL连接的超时与命令像set net_write_timeout=99999; set net_read_timeout=99999;，但它似乎没有帮助。

这是目前为止我的c#代码:

//Construct output DataTable
DataTable output = new DataTable();
MySqlDataAdapter ad = new MySqlDataAdapter(query, connection); 
try
{
    ad.FillSchema(output, SchemaType.Mapped); //Filling Columns, Types, Limitations
    ad.Fill(output); //Filling Data
    ad.Dispose();                
}
catch (Exception ex)
{ throw; }
return output;