如何将图像保存为DICOM
本文关键字：DICOM 保存 图像 | 更新日期: 2023-09-27 18:26:41
我需要使用c#和一些免费库将JPEG图像保存为DICOM。我读了很多关于如何做相反的事情的主题，但我找不到如何做我需要的事情。我能达到的最好效果是使用ClearCanvas保存图像，但它会失真。
DicomFile dicomFile = new DicomFile();
dicomFile.MediaStorageSopClassUid = SopClass.DigitalXRayImageStorageForPresentation.Uid;
dicomFile.DataSet[DicomTags.SopClassUid].SetStringValue(SopClass.DigitalXRayImageStorageForPresentation.Uid);
dicomFile.TransferSyntax = TransferSyntax.ExplicitVrLittleEndian;
dicomFile.DataSet[DicomTags.ImageType].SetStringValue(@"ORIGINAL'PRIMARY");
dicomFile.DataSet[DicomTags.Columns].SetInt32(0, width);
dicomFile.DataSet[DicomTags.Rows].SetInt32(0, height);
dicomFile.DataSet[DicomTags.BitsStored].SetInt16(0, bitsPerPixel);
dicomFile.DataSet[DicomTags.BitsAllocated].SetInt16(0, 8);
dicomFile.DataSet[DicomTags.HighBit].SetInt16(0, 7);
dicomFile.DataSet[DicomTags.PixelData].Values = imageBuffer;
dicomFile.Save("e:''tempFile.dcm");
有人能告诉我上面的代码出了什么问题吗？或者在任何其他免费库上提供一个简单的工作示例吗？
这只是一点代码，但我就是这样做的。这似乎是一个常见的重复问题。随着时间的推移，我从Clear Canvas论坛上拼凑出了这一点，但这是对所问问题的完全有效的回答。
如果需要从jpg等标准图像文件创建DICOM二次捕获图像，并且您希望它们能与所有PACS、VNA和其他DICOM应用程序正确工作，那么这里的代码适用于此。
好的，我得再编辑一次。这是我为了好玩而拼凑的，我只需要能够做到。我创建的一些DICOM图像添加到了我的测试套件中，但我用它比任何东西都更有趣。我拍了霍默·辛普森的大脑照片并把它包起来。还有"当放射科医生自拍时"的照片。不要忘记我做的最后一张照片，最近的新闻中有一张马里鳗鱼的高质量X光照片，所以我也用DICOM包了这张照片。这就是你看到的例子。
好吧，再编辑一次。自从写下这个答案以来，我发现了一个非常有价值的能力与这个代码。我可以以任何方式生成像素数据来测试我们的产品。我已经可以在Explicit Little Endian中生成10000 X 10000像素的DICOM图像，这肯定会给DICOM产品带来问题，但我可以用Clear Canvas生成它，不会有问题！
我还可以使用此代码使用简单的5 x 5像素小图像发送数据，这对快速构建大型数据库或增加某些积压的测试非常有帮助。我只希望其他人能发现这和我一样有用。
using ClearCanvas.Dicom.Codec;
using ClearCanvas.Common.Utilities;
using ClearCanvas.Dicom;
using ClearCanvas.Dicom.Network;
using ClearCanvas.Common;
using ClearCanvas.ImageViewer;
using ClearCanvas.ImageViewer.Imaging;
using ClearCanvas.ImageViewer.Graphics;
using ClearCanvas.ImageViewer.StudyManagement;
DicomFile df = null;
Bitmap bm = LoadImage(tbImageFile.Text);
CreateBaseDataSet();
df = ConvertImage(bm, 1);
df.Save(@"C:'test.dcm", DicomWriteOptions.Default);
然后是它的其余部分：
private void CreateBaseDataSet()
{
_baseDataSet = new DicomAttributeCollection();
//Sop Common
_baseDataSet[DicomTags.SopClassUid].SetStringValue(SopClass.SecondaryCaptureImageStorageUid);
////Patient
//_baseDataSet[DicomTags.PatientId].SetStringValue(_parent.PatientId);
//_baseDataSet[DicomTags.PatientsName].SetStringValue(String.Format("{0}^{1}^{2}^^",
// _parent.LastName, _parent.FirstName, _parent.MiddleName));
//_baseDataSet[DicomTags.PatientsBirthDate].SetDateTime(0, _parent.Dob);
//_baseDataSet[DicomTags.PatientsSex].SetStringValue(_parent.Sex.ToString());
////Study
//_baseDataSet[DicomTags.StudyInstanceUid].SetStringValue(DicomUid.GenerateUid().UID);
//_baseDataSet[DicomTags.StudyDate].SetDateTime(0, _parent.StudyDate);
//_baseDataSet[DicomTags.StudyTime].SetDateTime(0, _parent.StudyTime);
//_baseDataSet[DicomTags.AccessionNumber].SetStringValue(_parent.AccessionNumber);
//_baseDataSet[DicomTags.StudyDescription].SetStringValue(_parent.StudyDescription);
//Patient
_baseDataSet[DicomTags.PatientId].SetStringValue("PIDEEL");
_baseDataSet[DicomTags.PatientsName].SetStringValue(String.Format("Moray^Eel^X-Ray"));
//_baseDataSet[DicomTags.PatientsAddress].SetString (0,"Hubertus");
//_baseDataSet[DicomTags.PatientsBirthDate].SetDateTime(0, DateTime.Now);
//_baseDataSet[DicomTags.PatientsBirthDate].SetString(0, "19550512");
_baseDataSet[DicomTags.PatientsSex].SetStringValue("O");
//Study
_baseDataSet[DicomTags.StudyInstanceUid].SetStringValue(DicomUid.GenerateUid().UID);
_baseDataSet[DicomTags.StudyDate].SetDateTime(0, DateTime.Now);
_baseDataSet[DicomTags.StudyTime].SetDateTime(0, DateTime.Now);
_baseDataSet[DicomTags.AccessionNumber].SetStringValue("ACCEEL");
_baseDataSet[DicomTags.StudyDescription].SetStringValue("X-Ray of a Moray Eel");
_baseDataSet[DicomTags.ReferringPhysiciansName].SetNullValue();
_baseDataSet[DicomTags.StudyId].SetNullValue();
//Series
_baseDataSet[DicomTags.SeriesInstanceUid].SetStringValue(DicomUid.GenerateUid().UID);
_baseDataSet[DicomTags.Modality].SetStringValue("OT");
_baseDataSet[DicomTags.SeriesNumber].SetStringValue("1");
//SC Equipment
_baseDataSet[DicomTags.ConversionType].SetStringValue("WSD");
//General Image
_baseDataSet[DicomTags.ImageType].SetStringValue(@"DERIVED'SECONDARY");
_baseDataSet[DicomTags.PatientOrientation].SetNullValue();
_baseDataSet[DicomTags.WindowWidth].SetStringValue("");
_baseDataSet[DicomTags.WindowCenter].SetStringValue("");
//Image Pixel
if (rbMonoChrome.Checked )
{
_baseDataSet[DicomTags.SamplesPerPixel].SetInt32(0, 1);
_baseDataSet[DicomTags.PhotometricInterpretation].SetStringValue("MONOCHROME2");
_baseDataSet[DicomTags.BitsAllocated].SetInt32(0, 8);
_baseDataSet[DicomTags.BitsStored].SetInt32(0, 8);
_baseDataSet[DicomTags.HighBit].SetInt32(0, 7);
_baseDataSet[DicomTags.PixelRepresentation].SetInt32(0, 0);
_baseDataSet[DicomTags.PlanarConfiguration].SetInt32(0, 0);
}
if (rbColor.Checked)
{
_baseDataSet[DicomTags.SamplesPerPixel].SetInt32(0, 3);
_baseDataSet[DicomTags.PhotometricInterpretation].SetStringValue("RGB");
_baseDataSet[DicomTags.BitsAllocated].SetInt32(0, 8);
_baseDataSet[DicomTags.BitsStored].SetInt32(0, 8);
_baseDataSet[DicomTags.HighBit].SetInt32(0, 7);
_baseDataSet[DicomTags.PixelRepresentation].SetInt32(0, 0);
_baseDataSet[DicomTags.PlanarConfiguration].SetInt32(0, 0);
}
}
private DicomFile ConvertImage(Bitmap image, int instanceNumber)
{
DicomUid sopInstanceUid = DicomUid.GenerateUid();
string fileName = @"C:'test.dcm";// String.Format("{0}.dcm", sopInstanceUid.UID);
//fileName = System.IO.Path.Combine(_tempFileDirectory, fileName);
DicomFile dicomFile = new DicomFile(fileName, new DicomAttributeCollection(), _baseDataSet.Copy());
//meta info
dicomFile.MediaStorageSopInstanceUid = sopInstanceUid.UID;
dicomFile.MediaStorageSopClassUid = SopClass.SecondaryCaptureImageStorageUid;
//General Image
dicomFile.DataSet[DicomTags.InstanceNumber].SetInt32(0, instanceNumber);
DateTime now = Platform.Time;
DateTime time = DateTime.MinValue.Add(new TimeSpan(now.Hour, now.Minute, now.Second));
//SC Image
dicomFile.DataSet[DicomTags.DateOfSecondaryCapture].SetDateTime(0, now);
dicomFile.DataSet[DicomTags.TimeOfSecondaryCapture].SetDateTime(0, time);
//Sop Common
dicomFile.DataSet[DicomTags.InstanceCreationDate].SetDateTime(0, now);
dicomFile.DataSet[DicomTags.InstanceCreationTime].SetDateTime(0, time);
dicomFile.DataSet[DicomTags.SopInstanceUid].SetStringValue(sopInstanceUid.UID);
//int rows, columns;
//Image Pixel
if (rbMonoChrome.Checked)
{
dicomFile.DataSet[DicomTags.PixelData].Values = GetMonochromePixelData(image, out rows, out columns);
}
if (rbColor.Checked)
{
dicomFile.DataSet[DicomTags.PixelData].Values = GetColorPixelData(image, out rows, out columns);
}
//Image Pixel
dicomFile.DataSet[DicomTags.Rows].SetInt32(0, rows);
dicomFile.DataSet[DicomTags.Columns].SetInt32(0, columns);
return dicomFile;
}
private static byte[] GetMonochromePixelData(Bitmap image, out int rows, out int columns)
{
rows = image.Height;
columns = image.Width;
//At least one of rows or columns must be even.
if (rows % 2 != 0 && columns % 2 != 0)
--columns; //trim the last column.
int size = rows * columns;
//byte[] pixelData = MemoryManager.Allocate<byte>(size);
byte[] pixelData = new byte[size];
int i = 0;
for (int row = 0; row < rows; ++row)
{
for (int column = 0; column < columns; column++)
{
pixelData[i++] = image.GetPixel(column, row).R;
}
}
return pixelData;
}
private static byte[] GetColorPixelData(Bitmap image, out int rows, out int columns)
{
rows = image.Height;
columns = image.Width;
//At least one of rows or columns must be even.
if (rows % 2 != 0 && columns % 2 != 0)
--columns; //trim the last column.
BitmapData data = image.LockBits(new Rectangle(0, 0, columns, rows), ImageLockMode.ReadOnly, image.PixelFormat);
IntPtr bmpData = data.Scan0;
try
{
int stride = columns * 3;
int size = rows * stride;
//byte[] pixelData = MemoryManager.Allocate<byte>(size);
byte[] pixelData = new byte[size];
for (int i = 0; i < rows; ++i)
Marshal.Copy(new IntPtr(bmpData.ToInt64() + i * data.Stride), pixelData, i * stride, stride);
//swap BGR to RGB
SwapRedBlue(pixelData);
return pixelData;
}
finally
{
image.UnlockBits(data);
}
}
private static Bitmap LoadImage(string file)
{
Bitmap image = Image.FromFile(file, true) as Bitmap;
if (image == null)
throw new ArgumentException(String.Format("The specified file cannot be loaded as a bitmap {0}.", file));
if (image.PixelFormat != PixelFormat.Format24bppRgb)
{
Platform.Log(LogLevel.Info, "Attempting to convert non RBG image to RGB ({0}) before converting to Dicom.", file);
Bitmap old = image;
using (old)
{
image = new Bitmap(old.Width, old.Height, PixelFormat.Format24bppRgb);
using (Graphics g = Graphics.FromImage(image))
{
g.DrawImage(old, 0, 0, old.Width, old.Height);
}
}
}
return image;
}
private static void SwapRedBlue(byte[] pixels)
{
for (int i = 0; i < pixels.Length; i += 3)
{
byte temp = pixels[i];
pixels[i] = pixels[i + 2];
pixels[i + 2] = temp;
}
}