使用ClearCanvas将JPG图像文件编码为DICOM PixelData

本文关键字：编码 DICOM PixelData 文件 图像 ClearCanvas JPG 使用 | 更新日期: 2023-09-27 18:19:34

我有一组JPG图像，这些图像实际上是CT扫描的切片，我想将其重建为DICOM图像文件并导入PACS。

我正在使用ClearCanvas，并且已经设置了所有必要的标签（并通过使用专有应用程序将我的一个JPG文件转换为DICOM来确认它们，以确保它们是相同的）。我只是不确定我应该如何处理我的JPG文件以将其放入PixelData标签？

根据ClearCanvas论坛的建议，目前我正在将其转换为Byte数组，但DICOM查看器中的图像只是混乱的。我应该如何处理图像数据以使其成为可读格式？

    public DicomFile CreateFileFromImage(Image image)
    {
        int height = image.Height;
        int width = image.Width;
        short bitsPerPixel = (short)Image.GetPixelFormatSize(image.PixelFormat);
        byte[] imageBuffer = ImageToByteArray(image);
        DicomFile dicomFile = new DicomFile();
        dicomFile.DataSet[DicomTags.Columns].SetInt32(0, width);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.Rows].SetInt32(0, height);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.BitsStored].SetInt16(0, bitsPerPixel);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.BitsAllocated].SetInt16(0, bitsPerPixel);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.HighBit].SetInt16(0, 7);
        //other tags not shown
        dicomFile.DataSet[DicomTags.PixelData].Values = imageBuffer;
        return dicomFile;
    }
    public static byte[] ImageToByteArray(Image imageIn)
    {
        MemoryStream ms = new MemoryStream();
        imageIn.Save(ms, System.Drawing.Imaging.ImageFormat.Jpeg);
        return ms.ToArray();
    }

使用ClearCanvas将JPG图像文件编码为DICOM PixelData

ClearCanvas库作为两个辅助类，使DicomFile中的像素数据更容易编码和解码。它们是DicomCompressedPixelData类和DicomUncompressedPixelData类。您可以使用这些设置图像的参数，并将它们编码到DicomFile对象中。

在您的情况下，由于您正在对压缩对象进行编码，因此应该使用DicomCompressedPixelData类。类上存在可以设置的属性。调用UpdateMessage方法将把这些属性值复制到DicomFile对象上。此外，这个类有一个AddFrameFragment方法，可以正确地对像素数据进行编码。请注意，压缩的像素数据必须在每帧数据周围有一些特定的二进制包装器。这是您以前的代码中缺少的部分。下面的代码显示了如何设置。

        short bitsPerPixel = (short)Image.GetPixelFormatSize(image.PixelFormat);
        var dicomFile = new DicomFile();
        var pd = new DicomCompressedPixelData(dicomFile);
        pd.ImageWidth = (ushort)image.Width;
        pd.ImageHeight = (ushort) image.Height;
        pd.BitsStored = (ushort)bitsPerPixel;
        pd.BitsAllocated = (ushort) bitsPerPixel;
        pd.HighBit = 7;
        pd.SamplesPerPixel = 3;
        pd.PlanarConfiguration = 0;
        pd.PhotometricInterpretation = "YBR_FULL_422";
        byte[] imageBuffer = ImageToByteArray(image);
        pd.AddFrameFragment(imageBuffer);
        pd.UpdateMessage(dicomFile);
        return dicomFile;

我最终手动处理了位图，并在图像中的红色通道中创建了一个数组，下面是插件中的一些代码：

            int size = rows * columns;
            byte[] pData = new byte[size]; 
            int i = 0;
            for (int row = 0; row < rows; ++row)
            {
                for (int column = 0; column < columns; column++)
                {
                    pData[i++] = image.GetPixel(column, row).R;
                }
            }

它确实有效，但速度非常慢，并且会创建臃肿的DICOM文件。我很想让内置的DicomCompressedPixelData类正常工作。

欢迎提出任何进一步的建议。

在插入DICOM数据集之前，了解JPEG CT图像的位深度和颜色成分非常重要。它可以是8位有损的（JPEG压缩过程2）或12位有损（JPEG压缩进程4）或8、12或16位无损灰度JPEG（JPEG压缩处理14-无损、非分层）。此信息对于更新像素数据相关信息至关重要，例如光度解释、每像素采样、平面配置、分配的位、高位到传输语法。

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